犬冠状病毒感染的主要症状是呕吐和腹泻。可能与之混淆的疾病是犬细小病毒感染，肠炎型犬瘟热，犬传染性肝炎，细菌性肠胃炎，中毒性胃肠炎等。肠道疾病。

在上述混淆性疾病中，犬冠状病毒感染最类似于犬细小病毒感染。主要区别如下：

在流行病学上的差异，虽然犬冠状病毒感染发病率在2-4个月时最高，但2-3天龄的幼犬也会发病。细小病毒病很少发生在2个月大的年龄，并且在40日龄以下几乎不发生疾病;它的腹泻没有特殊恶心的细小病毒病，它的症状并不像细小病毒病一样迅速和暴力;细小病毒的心跳数量增加更多;感染犬冠状病毒感染常引起肠套叠，有些犬在恢复后2~3周复发。至于其他呕吐和腹泻的疾病，差异是显而易见的。首先，其他类似的疾病几乎不会导致肠套叠，并且在恢复2-3周后不会复发。

此外，肠炎型犬瘟热有明显的粘液脓性结膜炎，体内有特殊气味，脚垫粗糙且逐渐硬化，这些症状与犬冠状病毒感染无关。与传染性肝炎的主要区别在于犬冠状病毒感染在疾病开始时没有急性感冒的症状，在剑突过程中没有压痛，并且在恢复期间没有“蓝眼”现象。

疾病与细菌性肠胃炎和中毒性胃肠炎的区别在于后两者有其相应的原因，呕吐程度也相对较轻，且发病率没有年龄差异。

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